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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  34 lines
  1. ****************************************
  2. * Prenyl group binding site (CAAX box) *
  3. ****************************************
  4.  
  5. A number of eukaryotic  proteins  are  post-translationally  modified  by  the
  6. attachment  of either a farnesyl  or a geranyl-geranyl  group  to  a  cysteine
  7. residue [1,2,3,4]. The modification occurs on cysteine residues that are three
  8. residues away from the C-terminal extremity;  the  two  residues that separate
  9. this cysteine from the C-terminal residue  are generally  aliphatic. This Cys-
  10. Ali-Ali-X  pattern is  generally  known  as  the  CAAX  box. Proteins known or
  11. strongly presumed to be the target of this modification are listed below.
  12.  
  13.  - Ras proteins, and ras-like proteins such as Rho, Rab, Rac, Ral, and Rap.
  14.  - Nuclear lamins A and B.
  15.  - A number of G proteins (transducins) alpha and gamma subunits.
  16.  - 2',3'-cyclic nucleotide 3'-phosphodiesterase (EC 3.1.4.37).
  17.  - Rhodopsin-sensitive  cGMP 3',5'-cyclic  phosphodiesterase  alpha  and  beta
  18.    chains (EC 3.1.4.17).
  19.  - Some dnaJ-like proteins (such as yeast MAS5/YDJ1).
  20.  - A number of fungal mating factors (such as M-factor or Rhodotorucine A).
  21.  
  22. -Consensus pattern: C-{DENQ}-[LIVM]-x>
  23.                     [C is the prenylation site]
  24. -Last update: June 1994 / Text revised.
  25.  
  26. [ 1] Glomset J.A., Gelb M.H., Farnsworth C.C.
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  28. [ 2] Lowy D.R., Willumsen B.M.
  29.      Nature 341:384-385(1989).
  30. [ 3] Imagee A.I.
  31.      Biochem. Soc. Trans. 17:875-876(1989).
  32. [ 4] Powers S.
  33.      Curr. Biol. 1:114-116(1991).
  34.